頻譜分析儀采用頻率掃描超外差的工作方式。混頻器將天線上接收到的信號與本振產生的信號混頻，當混頻的頻率等于中頻時，這個信號可以通過中頻放大器，被放大后，進行峰值檢波。檢波后的信號被視頻放大器進行放大，然后顯示出來。要獲得正確的測量結果，必須正確地操作頻譜分析儀。
1、根據干擾信號的頻率確定干擾源
在解決電磁干擾問題時，重要的一個問題是判斷干擾的來源，只有準確將干擾源定位后，才能夠提出解決干擾的措施。根據信號的頻率來確定干擾源是簡單的方法，因為在信號的所有特征中，頻率特征是穩定的，并且電路設計人員往往對電路中各個部位的信號頻率都十分清楚。因此，只要知道了干擾信號的頻率，就能夠推測出干擾是哪個部位產生的。
對于電磁干擾信號，由于其幅度往往遠小于正常工作信號，因此用示波器很難測量到干擾信號的頻率。特別是當較小的干擾信號疊加在較大的工作信號上時，示波器無法與干擾信號同步，因此不可能得到準確的干擾信號頻率。
而用頻譜分析儀做這種測量是十分簡單的。由于頻譜分析儀的中頻帶寬較窄，因此能夠將與干擾信號頻率不同的信號濾除掉，精確地測量出干擾信號頻率，從而判斷產生干擾信號的電路。
2、根據干擾信號的帶寬確定干擾源
判斷干擾信號的帶寬也是判斷干擾源的有效方法。例如，在一個寬帶源的發射中可能存在一個單個高強度信號，如果能夠判斷這個高強度信號是窄帶信號，則它不可能是從寬帶發射源產生的。干擾源可能是電源中的振蕩器，或工作不穩定的電路，或諧振電路。當在儀器的通頻帶中只有一根譜線時，就可以斷定這個信號是窄帶信號。
根據傅立葉變換，單根的譜線所對應的信號是周期信號。因此，當遇到單根譜線時，就要將注意力集中到電路中的周期信號電路上。
